Фамилия Амикишиев — редкий и показательный пример того, как в одной фамилии сплавились арабский титул и тюркское слово. Её основа — мужское имя Амикиши, которое состоит из двух частей. Первая, «ами», — это искажённое арабское «амир» («повелитель, князь, военачальник»). В тюркских языках, особенно в азербайджанском, «амир киши» буквально значило «человек-амир», то есть мужчина, носящий титул амира, или просто «господин». Со временем стечение согласных упростилось, и «амир» перешло в «ами». Вторая часть, «киши», — тюркское «человек, мужчина» (в азербайджанском у этого слова есть и оттенок «муж, супруг», но в данном составном имени оно сохраняет первое, более широкое значение).

Суффикс -ев указывает на русскую модель образования: так оформляли фамилии от основ на согласный. Амикишиев — буквально «потомок Амикиши». Фамилия почти наверняка сформировалась в среде азербайджанцев или народов Закавказья, которые в XIX — начале XX века, входя в состав Российской империи, получали фамилии по русскому образцу. Встречается она преимущественно среди выходцев из Азербайджана и Дагестана, где арабские имена с тюркскими добавками — обычное дело.

Существует менее вероятная версия, что «ами» — это тюркское «амма» (дядя по отцу), но она не объясняет, почему в основе стоит именно «амикиши», а не «аммакиши». Правдоподобнее видеть здесь именно арабский титул: такая модель (титул + «человек») встречается и в других составных именах региона. Фамилия Амикишиев — не массовая, её носители рассеяны в основном по Азербайджану и постсоветским республикам. В России она встречается единично, в основном у потомков мигрантов из Закавказья.