Фамилия Ампенова звучит необычно для русского уха, и это не случайно. Её основа, скорее всего, не славянская, а тюркская или монгольская. Скорее всего, в основе лежит мужское имя Ампен или Ампан, которое могло быть прозвищем или производной формой от более длинного имени. В бурятском, калмыцком или казахском языках встречаются имена с корнем «амп-», «амбан-», которые могут означать «тихий», «спокойный» или быть связаны с титулом «амбань» (высокий чиновник в империи Цин, управлявший монгольскими землями). Таким образом, Ампенов — это, вероятно, сын или потомок человека по имени Ампен.

Суффикс «-ов» указывает на типичную русскую модель образования фамилий, но здесь он прикреплён к нерусской основе. Это говорит о том, что носители фамилии жили в зоне активных контактов с русским населением — скорее всего, в Забайкалье, Бурятии или на Алтае. В этих регионах фамилии на «-ов» часто давали бурятам, калмыкам и другим народам при переходе на оседлый образ жизни или при крещении. Ампенова — женская форма; мужская, соответственно, Ампенов.

Встречается фамилия редко. Основной ареал её бытования — Восточная Сибирь, особенно Бурятия и Иркутская область. Встречаются единичные записи в Забайкальском крае. Есть версия, что основа могла быть связана с диалектным словом «ампун» — так в некоторых сибирских говорах называли ленивого или медлительного человека, но эта гипотеза менее вероятна, так как не объясняет женского окончания «-а» в исходной форме. Более правдоподобно, что перед нами фамилия бурятского происхождения, русифицированная в XIX—XX веках.