Фамилия Амуленко — редкий случай, когда украинская патронимическая модель на -енко («сын такого-то») скрещивается с нерусской, скорее всего тюркской, основой. Суффикс -енко однозначно указывает на Украину: это самый распространённый формант, означающий потомка. В корне же — слово «Амул», которого в славянском именослове нет.

Самая правдоподобная версия: прозвище Амул восходит к тюркскому «амул» — амулет, талисман, оберег. Так могли прозвать человека, который делал или носил обереги, либо ребёнка, которого считали «хранимым», например выжившего после тяжёлой болезни. В среде украинских казаков, активно контактировавших с крымскими татарами и ногайцами, такое прозвище вполне могло прижиться. География фамилии это подтверждает: Амуленко встречается на востоке и юге Украины и в приграничных с ней областях России — там, где исторически были эти контакты.

Есть и другая версия, но она слабее: связь с топонимом Амул — древним названием города в Средней Азии (нынешний Туркменабад). Если предок происходил оттуда или торговал с теми краями, его могли прозвать по месту. Но для украинской среды это экзотика, и опираться на неё стоит в последнюю очередь.

В сословном плане Амуленко — фамилия крестьянская или казачья. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. В списках реестрового казачества XVII–XVIII веков она не встречается, но это не значит, что её не было среди вольных или запорожских казаков: многие фамилии просто не попали в уцелевшие документы. Однокоренные варианты — Амулов и Амулин — встречаются реже и чаще в русской среде, где суффиксы -ов/-ин указывают на принадлежность. Амуленко же остаётся характерной украинской формой, за которой стоит либо прозвище по занятию, либо память о далёких восточных связях.