Фамилия Амусьев — редкая, и её происхождение не сводится к одному очевидному ответу. На слух она воспринимается как типичная русская патронимическая фамилия: суффикс -ев указывает на отчество, то есть «сын Амуся». Но вопрос в том, кем был этот Амусь.

Самая прямая и вероятная версия выводит основу из крестильного имени Амос. В русской народной среде имя Амос (древнееврейского происхождения, означает «нагруженный, несущий ношу») могло звучать в уменьшительной форме Амусь или Амуся. Переход «о» в «у» — результат аканья и простонародного произношения, явление нередкое. Тогда фамилия Амусьев — вариант фамилии Амосов, образованный от разговорного прозвища. Имя Амос было распространено в среде духовенства и крестьянства, а фамилии на -ев от подобных форм встречаются часто. В пользу этой версии говорит и то, что у фамилий на -ин (например, Амусин) в основе обычно лежит имя или прозвище на -а/-я (Амуся), а Амусьев — параллельная форма, где суффикс -ев закрепился из-за того, что основа оканчивалась на мягкий согласный «сь», а не на гласный.

Однако есть и другая, более редкая гипотеза. Фамилия может быть связана с тюркскими корнями. В языках тюркской группы существует слово «амус» или близкие основы, означающие «защитник», «опора» или даже «медведь» (в переносном смысле — силач). В таком случае Амусь — не уменьшительное от Амоса, а самостоятельное прозвище, данное человеку по чертам характера или внешности. Учитывая, что русские фамилии нередко вбирали в себя иноязычные прозвища при контактах с татарами, башкирами или другими народами Поволжья, эта версия имеет право на существование, хотя и менее распространена. Сравнение с однокоренными фамилиями — Амосов, Амусин, Амусов — показывает, что Амусьев стоит особняком: у неё нет массового бытования, и в документах она встречается нечасто.

Таким образом, скорее всего, предок носителя фамилии Амусьев был человеком по имени Амос, которого в быту звали ласково Амусем. Но не исключено, что прозвище Амусь могло быть дано и как независимое, возможно, с тюркским оттенком значения. Фамилия эта хранит в себе следы народной фонетики и, возможно, межэтнических контактов.