Фамилия Анаятова — женская форма фамилии Анаятов, и это редкий случай в русской ономастике. Словообразовательная модель проста: к основе «Анаят» добавили русский патронимический суффикс -ов/-ев, который при русификации стал стандартным формантом для фамилий тюркского происхождения. Сама основа восходит к арабскому слову «инаят» (забота, милость, благосклонность). Через тюркские языки оно вошло в обиход как личное имя Анаят — его давали мальчикам с пожеланием, чтобы они росли под защитой и покровительством. Отсюда значения «опекаемый», «обласканный».

Такое происхождение сразу указывает на географию: скорее всего, предки носителей фамилии жили в Средней Азии, Закавказье или в тюркоязычных регионах России — Татарстане, Башкортостане, на Кавказе. Встречается и альтернативная версия: в некоторых диалектах «ана» — мать, а «ят» — суффикс принадлежности, так что Анаят могло означать «материнский», «родной по матери». Но эта гипотеза менее вероятна, поскольку имя Анаят как мужское зафиксировано в ономастических справочниках именно с арабским корнем.

Фамилия Анаятова — яркий пример того, как при переносе в русскую среду тюркское имя обрастает типично русским окончанием, но сохраняет память о восточных корнях. Носительницы этой фамилии с высокой вероятностью ведут род из мест, где смешивались славянские и тюркские традиции, — из казахских степей, Поволжья или Крыма.