Фамилия Антёнис — редкий пример литовского влияния на русский ономастикон. Её основа — литовское личное имя Antanas, соответствующее русскому Антон. Но фамилия образована не по русской модели (Антонов, Антошин), а по литовской: с суффиксом -is, который в мужских фамилиях указывает на принадлежность или происхождение. Буква «ё» в русском написании — результат адаптации: литовское Antėnis (с долгим ė) передали как Антёнис, сохранив ударение на второй слог.

Географически фамилия почти наверняка родом из западных регионов бывшей Российской империи — современной Литвы или прилегающих областей Беларуси и Польши, где исторически жили литовцы. В русских документах XIX — начала XX века такие фамилии часто записывали на слух, поэтому возможны варианты: Антенис, Антеннис, Антонис. Но форма с «ё» — самая характерная для русифицированного написания.

По словообразовательной модели Антёнис стоит в одном ряду с фамилиями вроде Буткус, Паулаускас, Янкаускас — все они сохранили литовский суффикс -is, который в русской традиции превратился в окончание. Если предок носителя звался Антанас, то его сын или потомок получал фамилию Антёнис — буквально «Антанасов» или «принадлежащий Антанасу».

Социальный контекст прост: в XIX веке литовские крестьяне и мелкая шляхта, попадая в российскую административную систему, получали фамилии по отцу или по имени. Антёнис — типичная фамилия-патроним, которая не указывает на ремесло или прозвище, а лишь фиксирует имя родоначальника. Встречаемость фамилии низкая, что объясняется её узкой региональной привязкой: после массовой литуанизации фамилий в межвоенной Литве многие носители сменили написание на литовский лад (Antėnis), и русская форма сохранилась в основном у потомков эмигрантов или в смешанных семьях.