Фамилия Аперян — яркий пример армянской модели фамилии, образованной с помощью суффикса -ян (-янц), который указывает на принадлежность к роду или происхождение от предка. В дословном переводе с армянского Аперян означает «сын Апера» или «потомок Апера». Основа фамилии — мужское личное имя Апер, которое сегодня встречается редко, но в прошлом было вполне употребительным.

Само имя Апер скорее всего восходит к армянскому слову «апэр» (ап’ер) — «старший», «почтенный», «уважаемый». В армянском языке это обращение к старшему по возрасту или статусу, что-то вроде «господин» или «батюшка». Таким образом, прозвище Апер мог получить человек, который отличался солидностью, возрастом или занимал руководящее положение в общине. В армянской традиции такие именования часто давались не при рождении, а как уважительное прозвище, которое со временем закреплялось за потомками.

С точки зрения географии, носители фамилии Аперян исторически концентрировались в Западной Армении (территория современной Восточной Турции), а также в регионах исторического расселения армян — в Киликии и на юге современной Армении. После геноцида армян 1915 года многие представители рода рассеялись по диаспоре: в Ливане, Сирии, Франции, США и России. В русскоязычной среде фамилия сохранила исходное написание, хотя в советских документах встречались варианты Аперьян или Аперов.

Словообразовательная модель фамилии простая и прозрачная: корень Апер- плюс патронимический суффикс -ян. В армянском языке суффикс -ян — самый распространённый способ образования фамилий, аналогичный русскому -ов/-ев или грузинскому -дзе. Фамилия Аперян не имеет отношения к тюркским или иранским корням, несмотря на созвучие с некоторыми словами в соседних языках.

Родственных фамилий, образованных от того же корня, немного: Аперянц (старая форма с суффиксом -янц, указывающим на род), Аперов (русифицированный вариант). В армянских источниках встречается также форма Аперян, но она может быть следствием диалектных различий в произношении.