Фамилия Аптечкина — женская форма, в основе которой лежит мужская фамилия Аптечкин. Её происхождение надёжно и прозрачно: она образована от слова «аптечка». Словообразовательная модель типична для русского севера и центральных областей: суффикс -ин указывает на принадлежность «чей?» — сын или дочь Аптечки, то есть человека, которого в быту прозвали Аптечкой.

Само прозвище Аптечка могло закрепиться за несколькими категориями людей. Самая вероятная версия — профессиональная. В XVII–XIX веках аптекарями называли не только владельцев аптек, но и фельдшеров, лекарей-самоучек, знахарей, которые торговали снадобьями вразнос или в маленьких лавках. Человека, который постоянно носил с собой ящик с лекарствами или держал домашнюю аптечку, односельчане легко могли прозвать Аптечкой. Такие профессиональные прозвища часто становились фамилиями, особенно в среде крестьян и мещан, где ремесло или занятие определяло человека.

Вторая, менее распространённая версия — прозвище по характеру. Аптечкой могли назвать чрезмерно осторожного, мнительного человека, который «лечил» каждую царапину или панически боялся болезней. Однако прямое указание на ремесло выглядит правдоподобнее: фамилия Аптечкин стоит в одном ряду с такими же прозрачными профессиональными фамилиями, как Докторин, Лекаркин, Фельдшерин, Знахаркин.

География фамилии неширокая, но характерная. Основные очаги — бывшие владимирские, ярославские и костромские земли, где фамилии на -ин вообще доминируют. Встречается она и в Поволжье, куда переселенцы из центральных губерний приносили свои прозвища. В дворянских родословных книгах Аптечкины не значатся: это фамилия крестьянского или мещанского сословия, что подтверждается и отсутствием в ней типичных дворянских суффиксов -ский или -ов.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Аптекарский, Аптекарев, Аптекин) показывает, что Аптечкина стоит ближе к бытовому, уменьшительному прозвищу, а не к официальному званию. Если Аптекарев — это прямой «аптекарь», то Аптечкин — скорее «Аптечка», что могло звучать одновременно и уважительно (как к человеку с лекарствами), и снисходительно (как к мелкому торговцу). Таким образом, носительница фамилии Аптечкина может считать своими предками людей, связанных с народной медициной или мелкой аптечной торговлей в дореволюционной российской глубинке.