Фамилия Аптечкина, в отличие от многих сложных для этимологии русских фамилий, имеет прозрачное и почти очевидное происхождение. Это женская форма фамилии Аптечкин, а значит, в основе лежит прозвище или именование мужчины-предка. Механизм образования типичен для русского севера и центральных областей: суффикс -ин отвечает на вопрос «чей?» и указывает на принадлежность — сын или дочь Аптечки.

Ключ к разгадке — слово «аптечка». В быту так могли прозвать человека, чья жизнь была неразрывно связана с лекарствами. Самая убедительная версия — профессиональная. В XVII–XIX веках аптекарями называли не только владельцев аптек, но и фельдшеров, лекарей-самоучек, знахарей, торговавших снадобьями вразнос или в маленьких лавках. Человека, который постоянно носил с собой ящик с лекарствами или держал домашнюю аптечку, односельчане легко могли прозвать Аптечкой. Такие профессиональные прозвища часто становились фамилиями, особенно в среде крестьян и мещан, где ремесло определяло человека. Фамилия Аптечкин стоит в одном ряду с такими же прозрачными фамилиями, как Докторин, Лекаркин, Фельдшерин, Знахаркин.

Вторая, менее распространённая версия — прозвище по характеру. Аптечкой могли назвать чрезмерно осторожного, мнительного человека, который «лечил» каждую царапину или панически боялся болезней. Однако прямое указание на ремесло выглядит правдоподобнее.

География фамилии неширокая, но характерная. Основные очаги — бывшие владимирские, ярославские и костромские земли, где фамилии на -ин вообще доминируют. Встречается она и в Поволжье, куда переселенцы из центральных губерний приносили свои прозвища. В дворянских родословных книгах Аптечкины не значатся: это фамилия крестьянского или мещанского сословия, что подтверждается отсутствием в ней типичных дворянских суффиксов -ский или -ов.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Аптекарский, Аптекарев, Аптекин) добавляет важный нюанс. Если Аптекарев — это прямой «аптекарь», официальное звание, то Аптечкин — это «Аптечка». Уменьшительная форма могла звучать одновременно и уважительно (как к человеку с лекарствами, к которому шли за помощью), и снисходительно (как к мелкому торговцу, а не учёному провизору). Таким образом, носительница фамилии Аптечкина может считать своими предками не столичных фармацевтов, а людей, связанных с народной медициной или мелкой аптечной торговлей в дореволюционной российской глубинке.