Скорее всего, Арфей — это вариант мужского канонического имени Арефий, которое имеет спорное происхождение. Согласно другой гипотезе, это имя восходит к греческому слову, имеющему значение «доблестный, добродетельный». Скорее всего, основатель рода Арфеевых был человеком из простого сословия. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Арфей, со временем получил фамилию Арфеева.