Фамилия Арнабекова — редкая и прозрачная по составу. Она образована от тюркского мужского имени Арнабек по стандартной русской патронимической модели: суффикс -ов и окончание -а указывают на принадлежность — «дочь или жена Арнабека». Если разбирать имя дальше, корень «Арна-» восходит к тюркскому «арна» — «чистый, светлый, прозрачный», то есть в переносном смысле «честный, непорочный». Реже этот корень связывают с названием казахского рода Арнау. Вторая часть, «-бек», — это широко распространённый тюркский титул, означающий «господин, князь, правитель». В сумме имя Арнабек переводится как «чистый (светлый) господин» или «князь из рода Арнау».

Интересная деталь: в отличие от многих тюркских фамилий, где основа «-бек» со временем стёрлась и стала просто частью звучания, здесь этимология остаётся прозрачной. Имя Арнабек — не арабское заимствование, а именно тюркское составное имя, что делает фамилию маркером определённой этнической группы, где такие двусоставные имена были нормой.

Географически фамилия редкая и локальная. Наибольшая концентрация носителей Арнабековых — в южных регионах России (Ставропольский край, Карачаево-Черкесия) и в Казахстане. Это указывает на возможные корни среди ногайцев, кумыков или казахов. Встречаются варианты написания с одной «б» — Арнабеков, но форма с двумя «б» более устойчива.

Сословно предки Арнабековых, вероятно, относились к свободным общинникам или мелкой знати. «Бек» в имени намекает на уважаемый статус основателя рода, но не обязательно на аристократию. В XIX веке при переписях такие фамилии записывали за крестьянами-однодворцами в пограничных губерниях. Скорее всего, носители происходят из тюркской среды, принявшей православие или перешедшей на русскую фамильную модель в ходе административного учёта.