Фамилия Арзаканцян — типичный пример армянской родовой фамилии, образованной по модели «прозвище + патронимический суффикс». Её основа указывает на конкретное место, а суффикс — на принадлежность к роду выходцев оттуда.

В основе фамилии лежит топоним Арзакан — село в Котайкской области Армении, известное своими лечебными минеральными водами. Жителя или уроженца этого села называли Арзаканец. Затем к этому прозвищу добавили армянский суффикс -ян (в диалектной форме -цян), который в армянском языке (как и в русском -ов/-ев) означает «из рода» или «из семьи». Таким образом, Арзаканцян буквально переводится как «из рода Арзаканца» — то есть потомок человека, происходившего из села Арзакан.

Словообразовательная цепочка здесь прозрачна: топоним Арзакан → оттопонимическое прозвище (Арзаканец) → фамилия с патронимическим суффиксом. Суффикс -цян встречается реже, чем стандартный -ян, и часто указывает на диалектное произношение или на более конкретную связь с местом (не просто «сын такого-то», а «выходец оттуда-то»).

Вероятнее всего, родоначальник фамилии был не просто связан с селом Арзакан, а именно переселился оттуда в другой регион, где и закрепилось за ним и его потомками прозвище по месту прежнего жительства. В армянской ономастике такие фамилии — один из самых распространённых типов: они фиксируют географическое происхождение рода, которое могло быть утеряно уже через поколение.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то можно встретить варианты Арзаканян (с обычным суффиксом -ян) и Арзаканц (с усечением). Форма Арзаканцян стоит в ряду таких фамилий, как Гюмрецян (из Гюмри), Эчмиадзинцян, Ереванцян — все они образованы по одной модели и указывают на конкретный населённый пункт как на родовое гнездо.