Фамилия Арзаканян — типичный пример армянской модели фамилии с суффиксом -ян, который восходит к древнему -янц, означавшему «из рода такого-то». В основе лежит личное имя Арзакан. В армянском языке это имя имеет прозрачную внутреннюю форму: оно связано со словом «арзак» — «достойный», «почтенный», «заслуживающий уважения». Соответственно, Арзаканян буквально значит «потомок достойного» или «из рода Арзакана».

Такие фамилии на -ян сложились в среде армянского купечества и ремесленников в основном к XVII–XIX векам, когда замена отчества наследственной фамилией стала массовой. Географически носители фамилии Арзаканян чаще всего встречаются в исторической Западной Армении (ныне восток Турции) и среди потомков армян, переселившихся на юг России, в Краснодарский край и Ростовскую область, а также в Армении.

Интересная деталь: в русском языке фамилия часто писалась с удвоенной «н» — Арзаканянн, что отражало старую орфографическую норму передачи армянского окончания -янц. Встречаются и варианты с заменой «з» на «с» (Арсаканян) — это следствие оглушения в диалектах или ошибок при записи в паспортных столах. Однако исходная форма с «з» — основная и этимологически верная.

Сословно фамилия не указывает на дворянство или духовенство: её носителями были преимущественно городские ремесленники, торговцы, позже — интеллигенция. В отличие от многих русских фамилий, образованных от названий профессий, Арзаканян построена на личной характеристике предка, а не на его занятии. Это роднит её с такими армянскими фамилиями, как Арутюнян (от «воскресение») или Геворгян (от имени Георгий), где основа — имя или качество, а не ремесло.