Фамилия Астаркина образована от имени Астарка — уменьшительной формы мужского имени Аристарх. Имя пришло из греческого языка и означает «предводитель лучших» или «лучший правитель». В святцах оно встречалось редко, поэтому и само имя Аристарх, и фамилии от него не получили широкого распространения. Двое святых — апостол Аристарх (память 17 января) и праведный Аристарх (27 января) — были покровителями имени, но популярным в народе оно так и не стало.

Фамилия образована по типичной русской модели: к основе Астарк- добавился суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — Астаркин). Суффикс -ин характерен для фамилий, образованных от слов женского рода или от основ на -а/-я, но в случае с мужскими именами на -а (Астарка) он работает по тому же принципу. В итоге Астаркин — это «сын Астарки» или «потомок Астарки».

Имя Аристарх, от которого пошла уменьшительная форма Астарка, — книжное, церковное. В крестьянской и посадской среде такие имена часто усекали и переделывали на бытовой лад: Аристарх превращался в Астарку, Асташу, Астаха. Поэтому основатель рода Астаркиных, скорее всего, был человеком из простого сословия — крестьянином или ремесленником. Фамилия недворянская, без приставок и «-ский», что тоже указывает на её происхождение в среде непривилегированных сословий.

Если сравнивать с похожими фамилиями, то Астаркин стоит в одном ряду с Астаховым, Асташевым, Астафьевым — все они восходят к разным формам имени Аристарх или близких к нему канонических имён (Евстафий, Анастасий). Но Астаркин — один из самых редких вариантов, что подтверждает нечастую встречаемость самого имени Аристарх в документах. Встретить эту фамилию можно в основном в центральных и северных регионах России, где дольше держалась традиция давать полные церковные имена, а не только их обиходные варианты.