Фамилия Аткочюс образована от аналогичного прозвища, которое связано с литовским словом atkeisti (atkeičia) – «менять, выменивать обратно, вернуть себе выменянное». Вполне вероятно, что именование Аткочюс получил человек, который занимался обменом чего-либо. Таким образом, прозвище могло содержать в себе указание на профессию его носителя.