Фамилия Аторкина — женская форма, мужская — Аторкин. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Аторка, а оно, скорее всего, образовано от глагола «торакать» (стучать, колотить). В русских говорах «аторкать» значило «забивать, вколачивать», а «оторка» — «затычка, пробка». Человек, которого прозвали Аторкой, мог быть плотником, бондарем или просто обладать привычкой стучать, шуметь, настойчиво добиваться своего.

Менее вероятна, но допустима связь с диалектным «атора» (спор, ссора, шум). Тогда Аторка — сварливый, беспокойный человек. Обе версии укладываются в модель образования отглагольных прозвищ на -ка, характерную для северных и центральных областей России.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — сын Аторки, Аторкин. Такая модель типична для фамилий, образованных от прозвищ и имён, оканчивающихся на -а, -я. Никакого отношения к тюркским или финно-угорским корням фамилия не имеет — это чисто славянская словообразовательная конструкция.

Фамилия редкая. Встречается в Нижегородской, Кировской областях и в Чувашии, что косвенно подтверждает севернорусское происхождение основы. В документах XVII–XVIII веков можно найти крестьян и посадских людей с прозвищем Аторка, но конкретных знаменитых носителей фамилии Аторкин в истории не зафиксировано.