Фамилия Аудитор — редкий случай, когда прозвище превратилось в наследственное имя, почти не изменившись. В отличие от большинства русских фамилий, образованных от крестильных имён или названий профессий с помощью суффиксов (-ов, -ин, -ский), эта фамилия представляет собой чистую основу. Она не обросла типичными окончаниями, что сразу выдает её позднее происхождение или нерусские корни носителя.

Слово «аудитор» пришло в русский язык из латыни через польское и немецкое посредничество. В Российской империи аудиторами называли военных юристов и чиновников, проводивших следствие и суд в армии. Должность появилась при Петре I, а в XIX веке аудиторы составляли особый корпус военно-судебного ведомства. Человек, получивший прозвище Аудитор, скорее всего, служил в этой должности или работал писарем при военном суде. В народной среде слово могло закрепиться за любым грамотеем, кто «разбирает дела» или ведёт учёт, — то есть за письмоводителем, бухгалтером или даже приказчиком.

В крестьянской среде фамилия Аудитор встречается крайне редко. Чаще она фиксировалась у выходцев из духовенства, мещан и солдатских детей, которые после отставки получали фамилию по своей специальности. Поскольку слово не склонялось по русским моделям, в документах могли писать «Аудиторов» или «Аудиторский», но именно форма Аудитор без суффикса сохранилась как более точная передача латинского корня auditor — «слушатель» (от audire — слушать). В древнеримской практике так называли чиновников, проверявших счета и выслушивавших отчёты, — отсюда современное значение «ревизор».

Споров вокруг этимологии практически нет: это прямое указание на профессию или должность. Фамилия не могла возникнуть как прозвище по внешности или характеру — слишком узкое и официальное слово. Исключение возможно только в случае, если её дали в семинарии: ученика, подслушивающего уроки, могли в шутку назвать Аудитором, но для семинарских фамилий типичнее латинизированные формы на -ус (например, Аудиторус). Поэтому основная и единственная версия — военно-юридическая служба предка.

Географически фамилия тяготеет к юго-западным губерниям и бывшим польским территориям, где институт аудиторов был особенно развит в армии. В современной России она остаётся крайне малочисленной, но встречается у потомков кантонистов и офицеров. Носителю фамилии стоит помнить: его предки не просто считали деньги, а вершили правосудие в армейской среде — были людьми с юридическим складом ума и властью над судьбами солдат.