Фамилия Авагжанов сразу выдает сложный восточный след, в котором переплелись армянское, персидское и тюркское влияния, а окончательно её оформила русская канцелярия XIX века. В основе лежит армянское слово «аваг» — не просто имя, а титул или почётное прозвище, означающее «старший», «старейшина», «глава». Его давали уважаемому человеку, наставнику или родовому вождю. К этому корню добавили персидский компонент «джан» — «душа», «жизнь». В тюркских и кавказских именах «джан» выступает как ласково-уважительная частица (сравните с Шахджан, Гюльджан). Получается, что полное имя Авагжан можно перевести как «душа-старейшина» или «уважаемый старший» — конструкция редкая и ёмкая.

Модель образования фамилии — чисто русская, патронимическая. К основе Авагжан добавили суффикс -ов, который в XIX — начале XX века в Российской империи массово присоединяли к нерусским именам, особенно в Закавказье и Средней Азии. Этот суффикс указывает на принадлежность: «сын Авагжана» или «из рода Авагжана». Если бы фамилия осталась в родной языковой среде, она могла бы звучать как Авагжанян (армянский вариант) или сохраниться как Авагжанов — уже через русскую административную систему.

Географически фамилия тяготеет к Узбекистану, Таджикистану и частично Казахстану, где сильно влияние иранских и тюркских языков. Встречается она также среди армян, переселившихся в Среднюю Азию в советское время. Редкость фамилии объясняется тем, что имя Аваг само по себе не было массовым, а двойная конструкция с «джан» встречается ещё реже.

Спорных версий почти нет: основа прозрачна, суффикс стандартен. Единственное, что может сбить с толку, — попытка увидеть в начале фамилии арабский корень «аваг» со значением «приют» или «убежище». Это ложный след: в арабском бытовых имён с таким корнем нет, а армянское «аваг» хорошо задокументировано в ономастике. Так что предки носителя фамилии Авагжанов, скорее всего, были людьми уважаемыми — старейшинами или духовными наставниками в своей общине, а сама фамилия закрепилась уже при переходе в русскую административную систему.