Фамилия Авходеевы происходит от мусульманского мужского имени Авхад. У этого имени арабские корни, и означает оно «первейший» или «единственный». Чередование гласных «а» и «о» в основе (Авхад → Авходеев) — результат исторических процессов, которые происходили в русском языке при адаптации иноязычных слов.

Сама фамилия относится к распространённому типу древнейших восточных фамилий, которые вели начало от тюркских носителей — выходцев из Золотой Орды, печенегов или половцев. Корни фамилии уходят в XV–XVII века. Именно в этот период многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими, что и способствовало проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий. Сведения о восточном происхождении фамилии Авходеевы считаются достаточно точными, поскольку подтверждаются соответствующим восточным именем родоначальника.

По своей словообразовательной модели фамилия типична для русской ономастики: к основе Авходей (русифицированная форма имени Авхад) добавился патронимический суффикс -ев, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Авходея). Таким образом, Авходеевы — это потомки человека по имени Авхад (Авходей). Фамилия представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры, сохранившийся в русской родовой традиции.