Фамилия Авцон — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Скорее всего, она имеет искусственное, семинарское происхождение, то есть была присвоена в духовных училищах или семинариях будущим священникам. В таких случаях фамилии часто образовывали от латинских или греческих слов, переводя на них русские прозвища или просто создавая благозвучные, «учёные» варианты.

В основе фамилии Авцон можно предположить латинское слово avus — «дед, предок» или avitus — «дедовский, предковский». Суффикс -он (от латинского -o, -onis) в семинарской среде был продуктивным: так появлялись фамилии вроде Авцон, Авитон. В таком случае фамилия означала бы «потомок предков» или «наследственный», что вполне вписывается в традицию давать фамилии, возвеличивающие род или происхождение.

Менее вероятна, но возможна связь с греческим словом аутос (αὐτός) — «сам», что дало бы значение «самодостаточный» или «единственный». Однако для семинарской практики латинская основа типичнее: грецизмы чаще оформлялись через суффиксы -опуло, -иди, а не -он. Географически фамилия Авцон встречается единично, преимущественно на юге России и Украины, что косвенно подтверждает её книжное, а не народное происхождение — в крестьянской среде такие фамилии не возникали.

По сути, Авцон — это фамилия-интеллектуал, созданная за письменным столом. Её носители, скорее всего, происходят из духовного сословия, и сама фамилия — не прозвище, а сознательный выбор, за которым стоит идея преемственности и родовой памяти.