Фамилия Айдубаев — яркий пример того, как тюркское имя обрело русскую форму благодаря многовековому соседству народов. Её основа, личное имя Айдуба, складывается из двух корней: «ай» (луна) и «дуба» (от арабского «дуа» — молитва, просьба). В тюркской традиции «ай» — не просто небесное тело, а символ красоты, света и удачи. Самая правдоподобная версия: имя Айдуба означало «лунная молитва» или «рождённый под лунной молитвой». Так могли назвать ребёнка, появившегося на свет в ясную ночь, когда семья обращалась к Всевышнему. Это не языческое поклонение светилу, а поэтическое пожелание: пусть дитя будет чистым и благословенным, как лунный свет.

Русский суффикс -ев, добавленный к основе, превратил имя в фамилию по стандартной для XIX — начала XX века модели. Айдубаев буквально означает «сын Айдубы». Такое оформление типично для тюркских народов, которые жили в тесном контакте с русскими: башкир, татар, казахов, ногайцев. Фамилия закреплялась в документах, когда человек получал паспорт, записывался в ревизскую сказку или переходил в православие.

География фамилии сегодня подтверждает её происхождение. Айдубаевы чаще всего встречаются в Башкортостане, Татарстане, Оренбургской и Челябинской областях, а также в Казахстане. Это зона расселения башкирских и татарских родов. В дореволюционных записях фамилию могли писать по-разному: Айдубаев, Айтубаев или даже Айдубай. Вариант с «д» вместо «т» — не ошибка писаря, а отражение звонкого произношения в некоторых тюркских говорах.

Социальный контекст говорит о том, что носители фамилии в XVIII–XIX веках были в основном государственными или ясачными крестьянами, реже — казаками. Айдубаевы не принадлежали к княжеским или мурзинским родам, их фамилия — «народная», без намёка на знатность. Но это не делает её менее ценной: она прямо указывает, что предок носил имя, связанное с небом и верой, и сохранила память о древнем тюркском обычае давать детям имена по обстоятельствам рождения.