Фамилия Айдынян — типичный пример армянской родовой фамилии, образованной по модели «имя + суффикс -ян». Суффикс -ян (в древней форме -янц) восходит к армянскому «азганун» — имени клана, и первоначально означал «из семьи таких-то» или «из рода таких-то». Соответственно, фамилия Айдынян имела значение «из рода Айдына».

Основа фамилии — мужское имя Айдын, фонетический вариант древнетюркского имени Айдин. В переводе на русский язык оно означает «светлый, лучистый; лучезарный». В древности слово «ай» имело переносные значения: «красивый, ценный; святой; чистый; умный; дорогой; счастливый». Согласно обычаю, ребенку, родившемуся во время сияния луны или полнолуния, давали имя, в состав которого входило «ай» — так подчеркивали связь с небесным светилом.

Важно: в русском языке фамилия встречается в двух написаниях — Айдинян и Айдынян. Первый вариант точнее передаёт тюркский корень через «и», второй закрепился в бытовом произношении. Оба варианта восходят к одному имени-основе и не меняют смысла фамилии.

Поскольку процесс формирования фамилий у армян завершился в основном к XIX веку, окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Айдынян можно лишь на основании глубоких генеалогических исследований. Тем не менее, фамилия остаётся памятником письменности и культуры Закавказья: в ней сплелись тюркское имя с армянским родовым суффиксом, что отражает многовековые контакты народов региона.