Фамилия Айникеева — один из тех случаев, когда внешне «инородное» звучание обманчиво. На слух она кажется тюркской или восточной, но на деле перед нами чисто русская по форме фамилия, образованная от редкого крестильного имени. Её основа — каноническое мужское имя Иоанникий, которое в просторечии звучало как Анникей или Ониникей. Это греческое имя (Иоанникиос) означает «победоносный», и в святцах оно встречается, но широкого хождения не имело, поэтому и фамилий от него осталось немного.

Модель образования типична для русского Северо-Запада и Поволжья: суффикс -ев присоединялся к основе, оканчивающейся на мягкий согласный. В имени Анникей основа Аннике- дала форму Анникеев. Начальное А- в фамилии Айникеева — результат диалектного «яканья» или просто графической замены: в старых документах букву «а» могли писать с йотом, чтобы подчеркнуть произношение. Так Анникеева превратилась в Айникееву, хотя корень остался тем же.

Интересно, что в некоторых говорах имя Иоанникий переосмыслилось как Аникей, и от него пошли фамилии Аникеев и Аникиеев. Айникеева стоит особняком: она встречается гораздо реже и указывает на конкретный регион бытования — возможно, на Вологодчину или Архангельскую область, где «аканье» и «яканье» сильно влияли на письменную фиксацию. Носитель фамилии — потомок человека по прозвищу или по отцу Айникей, то есть Иоанникий. Сословная принадлежность предков неясна, но скорее всего это были крестьяне или посадские люди: фамилии на -ев от редких имён в дворянской среде почти не встречаются. В метрических книгах XIX века Айникеевы могли записываться и как Аникеевы — разнобой в написании был обычным делом.

Сравнение с однокоренными фамилиями показывает, что Айникеева — это не опечатка и не случайность. В переписных книгах XVII века имя Анникей фиксируется в северных уездах, и именно там могла закрепиться форма с «й» перед «а». Встречается и мужской вариант Айникеев, но он ещё реже. Если вы столкнулись с этой фамилией у современного человека, перед вами редкий осколок старой северной ономастики, почти не изменившийся за двести лет.