Фамилия Айсагалиев восходит к мужскому имени Айсагали, которое состоит из двух основ. Первая из них, Айса, скорее всего, является фонетической формой имени Иса или Гайса (арабский вариант имени Иисус), которое означает «милосердие Аллаха, милость божья». Вторая часть имени – Гали – является диалектным вариантом мусульманского мужского имени Али. Оно имеет арабское происхождение и переводится как «великий, возвышенный, высший», «высокопоставленный; дорогой; мощный, сильный, могущественный». Это имя в исламе считается одним из 99 эпитетов Аллаха. Таким образом, потомок человека, которого звали Айсагали, со временем получил фамилию Айсагалиев.