Фамилия Айтбукешев — редкий пример двойного тюркского имени-основы, которое закрепилось в русской патронимической форме. Её смысл раскрывается при разборе двух корней: «Айт» и «Букеш».

Первая часть восходит к тюркскому глаголу айт- — «говорить, рассказывать». В личных именах казахов, ногайцев и каракалпаков этот корень означал «сказанное» или «наречённое» (сравните с именем Айтбай — «богатый на слова» или «сказанный богачом»). Вторая часть, «Букеш», — диалектный вариант имени, связанный с тюркским бүк («сгибать, гнуть») или бөке («препятствие, заслон»). В антропонимии этот корень мог указывать на «крепкого», «упрямого» человека или того, кто «преграждает путь».

Сложное имя Айтбукеш, таким образом, могло означать «тот, чьё слово — преграда» или «наречённый крепким». В тюркской традиции двухосновные имена (Айт + Букеш) нередко давали, чтобы подчеркнуть силу характера или пророческую важность пожелания, высказанного при рождении. Анализ словообразовательной модели показывает, что суффикс «-ев» — русский патронимический формант, который присоединяли к тюркским основам при русификации фамилий. В казахской среде, откуда, вероятнее всего, происходит фамилия, она звучала бы как Айтбөкешов (с казахским «ө»). Переход в «у» в русской записи — типичная фонетическая адаптация, не меняющая смысла.

Написание «Айтбукешев» с «е» в конце (а не «Айтбукешов») указывает на то, что фамилия оформлялась уже в русской канцелярии: суффикс «-ев» стандартно добавляли к основам на мягкий согласный или шипящий. Сословно фамилия не маркирована — её могли получить как рядовые кочевники, так и представители степной знати, бии или батыры. Встречается она преимущественно в Западном Казахстане и среди казахской диаспоры в России, что делает её географически привязанной к регионам, где исторически смешивались тюркские и русские административные традиции.