Фамилия Бадигуллина — женская форма фамилии Бадигуллин, и её происхождение напрямую связано с мужским личным именем. В основе лежит татарское или башкирское имя Бадигулла, которое представляет собой сложносоставное арабо-мусульманское имя. Первая часть «Бади» восходит к арабскому «бади» — «удивительный, прекрасный, дивный» (один из эпитетов Аллаха в исламе: «Создатель небес и земли, Творец из ничего»). Вторая часть — «гулла» (от «Алла», «Аллах»). Таким образом, имя Бадигулла означает «удивительный (прекрасный) раб Аллаха» или «дивный творением Аллаха».

Фамилия образована по русской модели: к татарскому имени добавили патронимический суффикс -ин, который в Поволжье и Приуралье прижился у многих нерусских народов. Бадигуллин — буквально «сын (или потомок) Бадигуллы». Окончание -а в женской форме указывает на принадлежность к роду или на замужнюю женщину из этого рода.

Географически фамилия Бадигуллина чаще всего встречается в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской и Челябинской областях — в зоне расселения татар и башкир. Сословно предки носителей фамилии относились к крестьянам или мещанам, в редких случаях — к духовенству, так как имя Бадигулла было популярно среди мулл и верующих, но не было исключительно религиозным.

Интересная деталь: в отличие от многих татарских фамилий, оканчивающихся на -ов (-ев), Бадигуллин сохранил более архаичный суффикс -ин, что указывает на то, что фамилия могла закрепиться в письменных источниках (ревизских сказках или метриках) раньше, чем массово начали использовать русские фамильные шаблоны с -ов. Другие версии происхождения — от тюркского прозвища или от географического названия — маловероятны, так как имя Бадигулла хорошо документировано в мусульманских именословах.