Фамилия Багытжанов — яркий пример казахской антропонимической модели, прошедшей через русскую паспортную обработку. Её основа — составное мужское имя Багытжан, которое в казахском языке складывается из двух корней: «багыт» (направление, путь, цель) и «жан» (душа, человек). В сумме имя можно перевести как «человек, указывающий путь» или «душа, стремящаяся к цели». В мусульманской ономастике «жан» часто выступает как компонент, придающий имени ласкательный или духовный оттенок, поэтому встречаются и более лиричные толкования — «душа моего пути».

Русский суффикс -ов, добавленный к основе Багытжан, — типичный способ адаптации тюркских и кавказских фамилий в Российской империи и СССР. В казахской среде фамилия звучала бы как Багытжанұлы (сын Багытжана), но для официальных документов требовалась форма с русским окончанием. Интересно, что в самой фамилии ударение может падать на последний слог (Багытжано́в) или на второй (Багы́тжанов) — это зависит от региональной традиции произношения, но в языке-источнике имя Багытжан имеет ударение на первом слоге: Ба́гытжан.

Встречаемость фамилии почти полностью сосредоточена в Казахстане и среди казахской диаспоры. Поскольку имя Багытжан — не самое частое, носители фамилии, скорее всего, восходят к одному или нескольким родственным родам. В казахском обществе фамилии на -ов не несли сословной окраски: их могли получить и потомки биев (судей), и скотоводы. Единственное, что можно утверждать с уверенностью, — предок носителя фамилии носил имя Багытжан, и это имя было ему дано с пожеланием стать человеком, идущим верной дорогой или ведущим за собой других.

Стоит заметить, что фамилия Багытжанов легко путается с похожей по звучанию, но иной по смыслу фамилией Багаутдинов (от арабского имени Бахауддин — «красота веры»). В документах XIX — начала XX века, когда казахские и татарские имена записывали на слух, возможны были разночтения, но корень «багыт» однозначно отсылает к казахской, а не арабской лексике.