Фамилия Багитжанова — это женская форма мужской фамилии Багитжанов, и её происхождение почти наверняка связано с тюркскими или арабо-тюркскими корнями. В основе лежит личное имя Багитжан, которое составное: первая часть, «Багит», восходит к арабскому «бахит» (ищущий, стремящийся) или к тюркскому «багыт» (счастье, удача), а вторая, «жан», — общеупотребительная в казахском, татарском и других тюркских языках частица, означающая «душа» или «жизнь». Таким образом, имя Багитжан можно перевести как «счастливая душа» или «ищущая душа», что характерно для многих восточных имён-пожеланий.

Суффикс «-ов(а)» в фамилии указывает на русскую модель оформления, типичную для народов, вошедших в состав Российской империи. В казахской среде, например, фамилии такого типа стали массово фиксироваться в XIX–XX веках, когда русская администрация приписывала местному населению фамилии по отцу. Фамилия Багитжанова — это, по сути, «дочь (или потомок) Багитжана». В самой Казахской степи исконная форма отчества или родового имени могла выглядеть как Багитжанулы (сын Багитжана) или Багитжанкызы (дочь Багитжана), но в документах закрепился русифицированный вариант.

Географически фамилия наиболее распространена в Казахстане и среди казахской диаспоры, реже встречается у татар и башкир. В России её носители сосредоточены в регионах с большим тюркским населением — в Оренбургской, Астраханской областях, в Татарстане. Интересно, что написание фамилии с буквой «ж» (Багитжанов, а не Багитжанов) выдаёт конкретный диалектный вариант произношения: в казахском и ряде других языков звук «дж» часто передаётся именно через «ж», тогда как в татарском могло бы быть «Багитжанов» с твёрдым «ж».

Сословная принадлежность предков обычно не фиксируется: фамилия не указывает на дворянство или купечество. Скорее всего, носители были крестьянами, скотоводами или мелкими ремесленниками. В редких случаях, если имя Багитжан носил уважаемый аксакал или батыр, фамилия могла закрепиться за целым родом, но это скорее исключение. Единственная сложность — возможная путаница с похожими фамилиями вроде Багитов или Багитдинов, где корень «багит» встречается в сочетании с другими формантами, но в случае Багитжановой составная часть «жан» снимает большинство сомнений.