Фамилия Бахеркина — женская форма фамилии Бахеркин. Сразу заметим: это не массовая, а довольно редкая фамилия, и её происхождение неочевидно. В отличие от типичных русских фамилий на -ов/-ев, здесь мы видим суффикс -ин, что указывает на принадлежность к предку по женской линии или на прозвище, оканчивавшееся на -а/-я. Но основа «Бахерк» — ключ к разгадке.

Самая вероятная версия связывает фамилию с профессиональным прозвищем «бахер». В южнорусских и украинских говорах «бахер» — это бондарь, мастер по изготовлению бочек, кадок и другой деревянной посуды. Слово, скорее всего, заимствовано из немецкого Böttcher (бондарь) через польское посредничество. Суффикс -к- в основе «Бахерк» мог выполнять уменьшительную или уничижительную функцию, то есть «бахерка» — это либо жена бондаря, либо молодой подмастерье. Таким образом, Бахеркин — потомок человека, которого в округе называли Бахерком (маленьким бондарем или сыном бондаря).

Есть и альтернативная, хотя и менее убедительная гипотеза. «Бахер» могло быть вариантом личного имени Вахер или Бахер — в некоторых регионах так могли переиначивать крестильное имя Варфоломей или даже Богдан. Однако в таком случае мы бы ожидали большего распространения фамилии в церковных записях, чего не наблюдается. Географически фамилия Бахеркины чаще всего встречается на юге России и в Восточной Украине — как раз в зоне активных контактов с немецкими колонистами и польским ремесленным влиянием.

Словообразовательная модель здесь нестандартна: если бы прозвище было «Бахер», фамилия звучала бы как Бахеров. Форма Бахеркин указывает на то, что прозвище имело суффикс -к(а), что характерно для прозвищ по роду занятий или по внешности (ср. Мельник — Мельниченко, но Бахер — Бахерка). В итоге носительница фамилии Бахеркина может с высокой долей уверенности считать, что её предки были связаны с бондарным ремеслом — делом нужным, но не самым престижным, что и закрепилось в прозвище с уменьшительным оттенком.