Фамилия Бактакунова — женская форма фамилии Бактакунов. В основе лежит тюркское мужское имя Бактакун, которое в свою очередь сложено из двух частей. Первая часть «бак» (или «бакт») восходит к древнетюркскому слову со значением «смотреть, глядеть», а в переносном смысле — «оберегать», «охранять», «быть покровителем». Вторая часть «кун» — это «день», «солнце» или «день как отрезок времени». Таким образом, имя Бактакун могло означать «оберегающий день» или «смотрящий на солнце». В тюркской ономастике такие двухосновные имена не редкость, они часто несли пожелательный смысл: родители надеялись, что сын будет жить под защитой светлого начала или станет хранителем своего рода.

Словообразовательная модель фамилии проста: к тюркской основе Бактакун добавлен русский патронимический суффикс -ов (в женском варианте -ова). Это типичный способ оформления нерусских по происхождению фамилий в среде, перешедшей на русский язык как основной. Фамилия фиксируется в основном в регионах, где исторически проживают тюркские народы: в Татарстане, Башкортостане, а также среди казахов и ногайцев. Встречаемость её невысока, что говорит о локальном бытовании, вероятно, в пределах одного-двух родов.

Интересная деталь: в отличие от многих фамилий на -ов, образованных от прозвищ или профессий, Бактакунова почти наверняка восходит именно к личному имени. Это значит, что предок, получивший это имя, не был прозван за какое-то качество или ремесло — имя ему дали при рождении, и оно несло в себе пожелание или характеристику, связанную с солнечным светом и охраной.

Встречаются варианты написания Бактакун, Бактакун-оглы, но фамилия Бактакунова — это уже полностью адаптированная русская форма. В документах XVIII–XIX веков, когда крестьяне и инородцы массово получали фамилии, имя Бактакун могли записать как есть, а затем, по законам русской грамматики, к нему добавили патронимический суффикс. Так из личного имени выросла фамилия, которая сегодня может рассказать о тюркских корнях и о том, что предки ценили свет и защиту.