Фамилия Балалайкина образована от прозвища Балалайка, которое восходит к аналогичному нарицательному. Такое прозвище мог получить человек, играющий на балалайке – русском народном струнном музыкальном инструменте с корпусом треугольной формы. Не исключено также, что прозвище Балалайка могло указывать на особенности характера и поведения человека. Поэтому можно предположить, что основатель рода Балалайкиных был задорным, веселым и словоохотливым человеком: слово "балалайка" подчас употреблялось как синоним слов "говорун", "балагур". Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Балалайка, со временем получил фамилию Балалайкина.