Фамилия Балгабаев образована от мужского тюркского имени Балгабай. Первая из них ведет свое начало от казахского «балга» - «плотный, крепкий, твердый», «молоток». Вторая часть имени восходит к древне-арабскому слову «бай», которое в переводе на русский язык означает «хозяин, богатый, состоятельный, могущественный человек, господин».