Фамилия Балгабаева ведет свое начало от мусульманского мужского имени Балгабай. Оно, в свою очередь, образовано от тюркских слов «бал» и «бай» с помощью уменьшительно-ласкательного аффикса –гай (–кай). Первое слово переводится на русский язык как «мед», а второе — как «хозяин; состоятельный, влиятельный человек, господин», в данном случае «ребенок». Таким образом, имя Балгабай, а, соответственно, и фамилия Балгабаева имеют значение «сладкий, как мед, ребенок». Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Балгабаевых можно лишь на основании генеалогических исследований.