Фамилия Балишина, скорее всего, женская форма от фамилии Балишин. В русской традиции фамилии на -ин обычно образуются от основ, оканчивающихся на -а или -я, и указывают на принадлежность: «чей?» — Балишин, то есть сын или потомок Балиши.

Корень «Бал-» здесь неочевиден и требует разбора. Самая вероятная версия — прозвище Балиша. В русских говорах слово «баля», «бала» означало «болтун», «пустомеля», а также «баловник», «шалун». Суффикс -иш- (-иша) в прозвищах часто имел увеличительное или пренебрежительное значение, как в словах «братиша» (старший брат) или «детиша». Таким образом, Балиша — это человек, который много говорит или склонен к шалостям, возможно, балагур. Менее распространённая, но возможная версия — связь с тюркским именем Балиш (встречается у татар и башкир), которое восходит к слову «балык» (рыба) или к глаголу со значением «быть известным». Однако для фамилии, бытующей в центральной России, первая версия (от прозвища) выглядит естественнее.

География фамилии Балишин (и, соответственно, Балишина) неширокая, но устойчивая. Чаще всего она встречается в Поволжье, особенно в Нижегородской области и в Чувашии, а также в некоторых районах Урала. Это указывает на возможную связь с переселенцами или с местными промыслами — например, прозвище могло закрепиться за торговцем рыбой (если принять тюркскую версию), но надёжных подтверждений этому нет.

В написании фамилии стоит обратить внимание на безударную гласную «и» в суффиксе: БалИшина, а не БалЕшина. Ошибки в документах встречаются, но исторически верное написание — через «и», так как суффикс -иш- в прозвищах не редуцировался до «е» в литературном языке. Если искать однокоренные фамилии, то к этому же гнезду относятся Балашов, Балакин, Балагуров — все они так или иначе связаны с понятиями говорливости, баловства или шумного поведения.

Таким образом, носительница фамилии Балишина может считать своим предком человека по прозвищу Балиша — скорее всего, словоохотливого или озорного крестьянина из центральной России или Поволжья, чьё прозвище закрепилось за родом в XVII–XVIII веках.