Фамилия Балькенова — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Чтобы понять её корни, нужно отбросить привычное ожидание славянской основы и присмотреться к тюркским языкам. Скорее всего, в основе лежит мужское имя Балькен (или Балхен), которое образовано от слова «бал» — «мёд» или «сладкий». В тюркской антропонимике имена с корнем «бал» (Балташ, Балбек, Балхан) были распространены: они давались как пожелание сладкой, благополучной жизни или как ласковое прозвище для ребёнка.

Суффикс «-ова» указывает на русскую модель оформления фамилии по женскому роду. Мужской вариант — Балькенов. Такая фамилия могла появиться у казахских, татарских, башкирских или ногайских родов в XIX веке, когда при составлении метрических книг и ревизских сказок тюркские имена русифицировали, добавляя типовые окончания. То есть предок носительницы этой фамилии, вероятно, звался Балькен, а его дети уже записывались как Балькеновы.

Есть и другая, менее вероятная версия. Фамилия может быть топонимической — от названия села Балькен (или Балхен), которое могло существовать в Поволжье или на Урале. Но в современных географических справочниках такое название не фиксируется, поэтому версия с личным именем выглядит убедительнее.

Что характерно: фамилия не входит в списки распространённых русских дворянских или крестьянских фамилий. Она почти не встречается в центральных регионах России, но может быть локально представлена в Оренбургской, Астраханской областях или в Башкортостане — в местах, где веками жили тюркские народы в соседстве с русскими. По сути, Балькенова — это «перевод» тюркского прозвища на русский фамильный шаблон, и за ней стоит конкретный человек, которого в своём ауле или деревне знали как «сладкого», «медового» — возможно, за мягкий характер или за занятие пчеловодством.