Фамилия Балхошина — женская форма фамилии Балхошин, и её происхождение, скорее всего, связано с прозвищем или мирским именем, которое давали человеку на Руси. Основа фамилии — «Балхоша» или «Балхош». В русских говорах слово «балхон» или «балхоша» могло означать «болтун», «пустомеля» или «хвастун» (от глагола «балхать» — говорить вздор, пустословить). Таким образом, прозвище Балхоша мог получить говорливый, несерьёзный человек, любитель приукрасить или почесать языком. Это типичная модель образования прозвищ по характеру или поведению, распространённая в северных и центральных регионах России.

Суффикс «-ин» в фамилии Балхошин указывает на принадлежность: «чей?» — сын Балхоши. Это один из самых древних и частых способов образования русских фамилий, особенно в среде крестьян и посадских людей. Если бы основа оканчивалась на согласный, мы бы видели суффикс «-ов», но здесь сработало правило «-ин» после основ на -а, -я.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с географическим названием. В некоторых регионах есть топонимы, созвучные с Балхоша (например, деревни с корнем «Балх-»). Однако в этом случае фамилия, скорее всего, имела бы суффикс «-ский» (Балхошинский), а не «-ин». Поэтому версия с прозвищем — основная и наиболее правдоподобная.

Фамилия редкая, в дореволюционных списках и метрических книгах встречается эпизодически, преимущественно на территории бывших Новгородской и Вологодской губерний. Это подтверждает связь с северными говорами, где слово «балхоша» было в ходу. Носители фамилии — потомки крестьян или ремесленников, которых когда-то впервые записали по отцу или деду — Балхоше. Никакого отношения к знатным родам или иностранным языкам фамилия не имеет.