Фамилия Бараченков образована по одной из самых распространённых в России моделей — с помощью суффикса -ов, который добавлялся к основе, оканчивающейся на твёрдый согласный. В данном случае основа — Бараченко, а -ов — притяжательный суффикс, указывающий на принадлежность («сын Бараченко»). Такая цепочка типична для фамилий, возникших в среде украинского или южнорусского крестьянства, где сначала закрепилось прозвище или патроним на -енко (Бараченко), а затем, при переходе в великорусскую документацию, к нему добавили фамильный суффикс.

Корень фамилии — Барач- — восходит к прозвищу Барач. В русских говорах «барач» (или «барачок») — это небольшой баран, ягнёнок, а также переносно — упрямый, настырный человек. В украинском языке «бара́н» звучит как «бара́н», но форма «барач» могла быть уменьшительно-ласкательной или указывать на молодое животное. Таким образом, исходное прозвище Барач могли дать либо пастуху, либо человеку с характером барана — упёртому, но не злому.

Менее вероятна, но возможна связь с тюркским словом «барач» — «ходящий, бродячий» (от «бар» — идти). В пользу этой версии говорит то, что фамилии с корнем Баран- и Барач- встречаются в регионах, где русские соседствовали с тюркскими народами (Поволжье, юг России). Однако для фамилии Бараченков украинско-русское происхождение выглядит убедительнее: суффикс -енко — один из главных маркеров украинской ономастики.

Фамилия не относится к числу аристократических или дворянских. Её носители — скорее всего, потомки крестьян или казаков из южных губерний Российской империи (Курская, Воронежская, Харьковская, область Войска Донского). В XIX веке Бараченковы фиксируются в основном в этих краях, что подтверждает гипотезу о прозвище, связанном с сельским бытом и животноводством.