Фамилия Барахтанов не имеет однозначного толкования. В основе лежит прозвище Барахтан, и у исследователей есть как минимум две версии его происхождения.

Первая версия связывает прозвище с характером человека. «Барахтаться» в русских говорах значит биться, возиться, упрямиться. Соответственно, Барахтаном могли назвать человека неуживчивого, капризного или драчливого — того, кто постоянно «барахтается» в спорах и ссорах. Эта версия лежит на поверхности и кажется самой очевидной.

Вторая версия — более редкая и неожиданная. Она отталкивается от созвучия со словами «бархат» или «бархот». Но речь не о ткани. «Бархотом» на Каме и реке Лузе называли большую барку — грузовое судно, поднимавшее до 35 тысяч пудов. В этом случае прозвище Барахтан мог получить не скандалист, а человек, связанный с речным делом: рыбак, судоходец или владелец такого судна. Фамилия тогда указывала бы на профессию предка.

Обе версии имеют право на существование, и без точных записей о первом носителе выбрать главную сложно. Ясно одно: фамилия образована по стандартной русской модели отчества — от прозвища на -ан с помощью суффикса -ов. Барахтанов буквально означает «сын Барахтана».