Фамилия Башковатов — одна из тех русских фамилий, где за необычным звучанием скрывается конкретное ремесло или должность. Её основа — слово «башковат», которое в некоторых говорах означало не просто «большеголовый», а человека сметливого, сообразительного, «с башкой». Однако есть и другая, более прозаичная версия: «башковать» могли называть того, кто занимался обработкой башек — особых болванок для валяных шляп или деревянных колодок для обуви. Слово «башка» в старых промыслах имело узкое техническое значение, и прозвище могло закрепиться за мастером.

Суффикс -ов в фамилии указывает на типичную русскую модель «чей?» — сын или потомок Башковата. Форма на -ов, а не -ин, говорит о том, что исходное прозвище было не на -а/-я, а на твёрдый согласный: Башковат, а не Башковатый. Встречается и параллельная фамилия Башковатов, и более редкая Башковатов — разница только в орфографии, закреплённой при записи в метрических книгах.

Географически фамилия тяготеет к центральным и поволжским губерниям, особенно к Нижегородской и Костромской областям. Там в XIX веке были распространены валяльные и деревообрабатывающие промыслы, где слово «башка» имело хождение. Встречается фамилия и на Урале, куда переселенцы принесли свой говор.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Башков, Башмаков, Башлыков — показывает, что Башковатов образована от менее частотного прозвища, что делает её более редкой и локальной. Если Башков мог произойти от прозвища «Башка» (голова, умник), то Башковатов — от производной формы с суффиксом -ат, который в русских говорах означал обладание признаком: «башковатый» — наделённый умом или, наоборот, большой головой.

Таким образом, предки носителя фамилии Башковатов с равной вероятностью могли быть либо ремесленниками, делавшими шляпные болванки или обувные колодки, либо просто людьми, которых в деревне прозвали за сметливость. В обоих случаях фамилия честно отражает либо занятие, либо характер — без вычурности, по-рабочему.