Фамилия Батонджанашвили — редкий пример того, как дальние языковые и культурные миры сошлись в одном родовом имени. Её основа, имя Батонджан, составная: первая часть, Батон, восходит к монгольскому «бодон» — «вепрь», а вторая, «джан», имеет персидские корни и означает «душа». Вместе имя переводится как «душа вепря» — образ сильный и необычный для антропонимикона.

Имя Батонджан (встречается также вариант Бодонджан) фиксируется у бурят и монголов, которые исторически не имели прямых контактов с грузинами. Именно этот разрыв объясняет, почему фамилия с грузинским суффиксом -швили («дитя», «потомок») осталась малораспространённой. Скорее всего, носитель такого имени или один из его предков оказался в грузинской среде, где его прозвище или личное имя оформили по местной модели. Грузинский суффикс указывает на принадлежность к роду, но исходное имя выдаёт степное, кочевое происхождение.

Фамилия Батонджанашвили — не массовая, а штучная. Она не встречается в распространённых грузинских фамильных списках и не имеет аналогов среди частых родовых имён Грузии. Это говорит о том, что её появление — результат единичной миграции или редкого межкультурного контакта, возможно, связанного с торговлей или военными походами.