Фамилия Батонджанашвили образована от имени Батонджан, которое состоит из двух компонентов. Первая часть имени — Батон — вероятно, происходит от слова «бодон», что в переводе с монгольского означает «вепрь». Компонент «джан» имеет персидские корни и переводится как «душа». Таким образом, имя Батонджан можно перевести как «душа вепря». Фамилия Батонджанашвили является достаточно редкой. Следует отметить, что имя Батонджан (Бодонджан) встречается у бурят и монголов, не имевших прямых контактов с грузинами. Вероятно, этот факт и объясняет, почему фамилия Батонджанашвили является малораспространенной.