Фамилия Баублис звучит на русском ухе необычно, но для Литвы и Латвии её строение совершенно прозрачно. Это фамилия литовского происхождения, образованная по типичной для литовской ономастики модели. В основе лежит литовское слово baublys или baubas — так называют пугало, страшилище, а в переносном смысле — ворчуна, брюзгу или человека с громким, низким голосом (от глагола baubti — реветь, мычать, громко кричать). Суффикс -is в литовском языке — стандартный показатель мужского рода в именительном падеже, то есть Баублис буквально означает «Тот, кто мычит» или «Ворчун».

Анализируем не корень, а суффиксальную модель. В русских фамилиях мы привыкли к окончаниям -ов, -ин, -ский. Литовская система иная: фамилии часто заканчиваются на -ас, -ис, -ус. Баублис — яркий представитель этого типа. При переходе в русский язык фамилия не получила дополнительного русского суффикса, а сохранила литовское окончание, что указывает на относительно позднюю фиксацию документах (в основном XIX–XX века) или на то, что носители сохраняли национальную форму фамилии.

Прозвище, от которого пошла фамилия, могло закрепиться за человеком с громким голосом, пастухом, который перекликался со стадом, или за угрюмым, нелюдимым человеком, которого в деревне побаивались. Связь с «пугалом» (baubas) намекает на возможную охранительную функцию: такое прозвище могли дать, чтобы отогнать злых духов, или же за внешнюю неопрятность.

Географически фамилия Баублис распространена в основном в Литве и среди литовской диаспоры. В России она редка и встречается преимущественно в Калининградской области и в регионах, куда переселялись литовцы в XIX веке. В польском языке существует похожая фамилия Баублис (Baublis), но польская традиция чаще давала форму Баублевич. Таким образом, Баублис — это чисто литовская фамилия, которая не переводилась и не калькировалась, а пришла в русский обиход в исходном звучании.