Фамилия Бублис, вероятно, представляет собой фонетический вариант фамилии Бублиц, которая ведёт начало от немецкого географического названия Бублиц (в Померании). Очевидно, основатель рода Бублис был выходцем из Бублица. Возможно, появление конечного «с» вместо «ц» обусловлено балтийским влиянием.