Фамилия Баумгертнер — немецкая, и её значение напрямую связано с садоводством. В основе лежит немецкое слово Baumgarten — «плодовый сад», а суффикс -er указывает на человека по роду занятий или по месту жительства. Проще говоря, Баумгертнер — это садовник, тот, кто ухаживает за фруктовым садом. Такое прозвище могли дать либо профессиональному садоводу, либо просто владельцу большого сада при доме.

Но есть и вторая версия, не менее правдоподобная. Суффикс -er в немецких фамилиях часто указывает не на профессию, а на происхождение из конкретного места. В Германии существует несколько десятков населённых пунктов с названием Баумгартен — от коммун до крошечных хуторов. Например, коммуна Баумгартен (Варнов) в земле Мекленбург — Передняя Померания. В таком случае фамилия Баумгертнер означала бы «тот, кто родом из Баумгартена».

Обе версии не противоречат друг другу: и садовник, и выходец из одноимённого местечка могли получить одно и то же прозвище. Выбрать одну из них без знания конкретной семейной истории невозможно, но для большинства носителей фамилии обе трактовки остаются рабочими. В отличие от многих русских фамилий, образованных от имени или отчества, Баумгертнер — чисто немецкая по корню и модели, и в России она встречается редко, чаще всего у потомков немецких колонистов, переселившихся в XVIII–XIX веках.