Фамилия Байбахтиев образована от восточного мужского имени Байбахти, которое является составным и восходит к двум словам: тюркскому «бай», имеющему значение «богатый господин», «землевладелец», «скотовод», и таджикскому «бахти» - «счастливый». Вероятно, нарекая ребенка таким именем, родители желали, чтобы их сын в будущем стал состоятельным и влиятельным человеком. Таким образом, потомок человека, которого звали именем Байбахти, со временем получил фамилию Байбахтиев.