Фамилия Байлеганов — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не ремесло, а, скорее всего, географическая или этническая характеристика, причём с тюркским корнем. Разберём её по частям: первая половина «Бай» в тюркских языках означает «богатый», «господин» или «знатный», вторая — «леган» — затемнена и требует отдельного разбора.

Самая правдоподобная версия связывает «Леган» с этнонимом «лезгин» (леги). В русских говорах и в прошлом, и в некоторых диалектах до сих пор выходцев из Дагестана могли называть «леганами» или «леками». Соответственно, Байлеганов — это буквально «богатый лезгин» или «знатный легин». Такое прозвище мог получить зажиточный человек лезгинского происхождения среди соседних народов (например, у ногайцев, кумыков или казахов). Модель образования простая: тюркское прозвище (Бай-леган) + русский патронимический суффикс -ов, который закрепил фамилию за потомками этого человека.

Менее вероятная, но не исключённая версия: «Леган» — искажённое арабское имя или прозвище, например, связанное с «лаган» (миска, таз). В этом случае Байлеган — «богатая миска», то есть прозвище щедрого или сытого человека. Однако географическая привязка фамилии к регионам с тюрко-дагестанским пограничьем (Ставрополье, Астраханская область, Калмыкия, Дагестан) делает версию с этнонимом более сильной.

Суффикс -ов указывает, что фамилия оформилась в русской канцелярской среде, скорее всего, в XIX — начале XX века, когда тюркские прозвища массово записывали по русскому образцу. Сословно предки Байлегановых могли быть как казаками, так и крестьянами или мещанами из смешанных тюрко-кавказских областей. Точных данных о конкретных известных носителях нет, но сама фамилия — живое свидетельство того, как в прозвище могли уместиться и социальный статус, и этническая принадлежность предка.