Фамилия Баймалух — редкий случай в русском ономастиконе. Её сразу выделяет окончание -ух, которое почти не встречается в стандартных фамилиях на -ов, -ин или -ский. Такая модель характерна для украинских или западнорусских прозвищных фамилий, где суффикс -ух придавал слову оттенок ласкательности или, наоборот, грубоватой простонародности (ср. украинские Бондарух, Ковалюх). В русском языке этот формант встречается в основном в северных и сибирских говорах, где отчество или прозвище могли застыть в форме «чей?»: Иванух, Петрух. Баймалух, скорее всего, образован от прозвища Баймало или Баймал, к которому добавили этот суффикс.

Основа фамилии — Баймал — тюркского происхождения. Она состоит из двух частей: «бай» (богатый, господин, хозяин) и «мал» (скот, имущество, богатство). В тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) слово «баймал» или «бай-мал» означает «богатый скотом», «состоятельный хозяин». Это типичное для кочевых народов именование, которое давали человеку, владевшему большим стадом. Позже такое прозвище могло закрепиться за его потомками.

Скорее всего, фамилия Баймалух сформировалась на стыке двух культур — тюркской и славянской. Предок носителя этой фамилии был тюркоязычным (татарином, башкиром или казахом), которого в русской среде прозвали по его достатку — Баймал. А уже его дети или внуки получили фамилию по этому прозвищу с местным суффиксом -ух. Такое смешение типично для Поволжья, Урала или южнорусских степей, где русские крестьяне и казаки долго жили бок о бок с тюркскими народами.

Географически фамилия почти не прослеживается в центральных областях России. Единичные носители встречаются в Башкортостане и Татарстане, что подтверждает версию о тюркской основе. Встречается и вариант написания Баймалук — с конечным «к» вместо «х», что объясняется особенностями местного произношения или ошибками при записи в метрических книгах.

Другие версии — например, связь с кавказским именем Баймал или с арабским «байт аль-мал» (казна) — маловероятны, так как они не объясняют появление суффикса -ух. Фамилия Баймалух — не просто переделка тюркского имени, а живой пример того, как прозвище, данное по хозяйственному статусу, обрастало местными языковыми чертами и становилось родовым именем.