Фамилия Байжанакова образована от мужского имени Байжан. Основа здесь — два тюркских корня: «бай» (богатый, знатный, господин) и «жан» (душа, человек). В сумме имя Байжан можно перевести как «богатая душа» или «знатный человек». Это составное имя, типичное для казахской и других тюркских ономастик, где оба компонента несут положительную характеристику.

Суффикс «-ова» указывает на принадлежность: Байжанакова — «дочь (или жена) Байжана». В русской традиции фамилии на «-ов/-ев» и «-ин» закреплялись за женщинами в форме женского рода, а мужским вариантом будет Байжанаков. Такая модель фамилий массово возникла у тюркских народов в XIX–XX веках под влиянием русской паспортной системы.

Географически фамилия Байжанакова чаще всего встречается в Казахстане, особенно в южных и западных областях. Встречаются варианты написания с одной «н» — Бажанова, но это уже другая фамилия с иным значением (от имени Бажан, уменьшительного от Богдан или Бажен). Байжанакова сохраняет полную основу, что говорит о сравнительно позднем оформлении — в эпоху, когда имя Байжан уже не сокращали в быту.

Сословно предки носительницы фамилии, скорее всего, были скотоводами или земледельцами. Имя Байжан не указывает на аристократическое происхождение, но подчёркивает уважение к человеку: его могли дать ребёнку в надежде на достаток и душевное благородство. Встречается и другая версия: в некоторых тюркских диалектах «жан» могло означать «сторона» или «край», тогда Байжан — «богатая сторона», но это менее вероятно, так как в личных именах компонент «жан» почти всегда означает «душа».

Таким образом, фамилия Байжанакова — это женская форма отчества-прозвища, которое в основе содержит пожелание богатства и душевной щедрости. Она плотно связана с казахской культурой и не имеет аналогов в славянской среде.