Фамилия Бекдосов — редкий случай, когда тюркская основа не вызывает споров, а вот её точное значение требует оговорок. Корень здесь — «бек» (господин, князь, начальник), широко распространённый в фамилиях татар, башкир, казахов и народов Кавказа. Вторая часть, «дос», скорее всего, восходит к тюркскому «дус» или «дос» — «друг», «товарищ». Буквально Бекдос означает «друг бека» или «друг господина». Такое прозвище могли дать приближённому слуге, оруженосцу или младшему дружиннику, который состоял при знатном человеке, но не был его родственником.

Русский суффикс -ов стандартно оформил фамилию по модели «чей?» — сын Бекдоса. Интересно, что в отличие от многих татарских фамилий на -ов, здесь нет редукции гласных: ударение, скорее всего, падает на последний слог (Бекдосо́в), что сохраняет тюркское звучание основы. Встречается также вариант Бекдосов без перехода «с» в «ш» — это указывает на то, что фамилия закрепилась в письменной форме довольно поздно, когда процессы адаптации тюркских имён в русской среде уже замедлились.

С точки зрения географии, Бекдосовы — это преимущественно фамилия волго-уральского региона. По данным переписей и метрических книг XIX века, она встречается у крещёных татар (кряшенов) и в некоторых башкирских родах юго-востока Татарстана и Оренбуржья. В дворянские родословные книги эта фамилия не попала — её носители были, как правило, государственными крестьянами или однодворцами, что подтверждает «народное» происхождение прозвища: друг бека, а не сам бек.

Однокоренные фамилии — Бекбулатов, Бекмурзин, Бектемиров — часто строятся по той же схеме, но с другими вторыми основами. Бекдосов выделяется на их фоне тем, что указывает не на родство или возраст («булат» — сталь, «мурза» — князь), а на социальную роль: доверенное лицо. Это редкий случай, когда фамилия прямо говорит о положении предка не по статусу, а по функции при вышестоящем лице.