Фамилия Бехонский — редкая, и её значение напрямую зависит от того, какой именно корень лёг в основу. Словообразовательная модель проста: суффикс -ск- указывает на типично польский или западнорусский (шляхетский) способ образования фамилий от географических названий. Чаще всего такие фамилии отвечали на вопрос «откуда родом»: Бехонский — выходец из места с корнем Бехон-.

Главная сложность — в этимологии этого корня. Самая правдоподобная версия связывает его с топонимом Бехонь или Бехоново. Такие названия встречаются в исторических землях Речи Посполитой (современные Польша, Беларусь, Западная Украина). Название, в свою очередь, могло произойти от прозвища или имени Бехон — варианта древнеславянского имени Бех (сокращение от Бехослав, Бехомир) или от диалектного слова «бех» (в некоторых говорах — «бегун», «быстрый»). Таким образом, первый носитель, вероятно, владел землёй или жил в местечке, которое носило имя своего основателя по прозвищу Бехон.

Менее вероятная, но возможная версия — от немецкого корня. В Польше и на Волыни встречались переселенцы-немцы, и фамилия могла быть адаптацией немецкой фамилии Bechon (от Bech — «пекарь») с добавлением польского суффикса -ский на русской почве. Однако для этого нет прямых документальных подтверждений, и версия с местным топонимом выглядит органичнее.

В дореволюционной России фамилия Бехонский могла принадлежать как потомкам польской шляхты, перешедшим на русскую службу, так и духовенству — семинаристы часто получали фамилии по названиям родных сел или приходов. Сословная принадлежность не прослеживается однозначно, но суффикс -ский сам по себе не гарантирует дворянства: в XIX веке его активно давали и крестьянам при записи «выходцев из» какого-либо места.

Сейчас фамилия встречается крайне редко, преимущественно в России и Украине. Её уникальность — в том, что она почти не имеет однокоренных «собратьев» (в отличие от Бехтерев или Бех), что подтверждает её происхождение от конкретного, возможно, уже исчезнувшего селения.