Фамилия Бексеитов — характерный пример фамилий, образованных от составного тюркского имени. Её основа — мужское имя Бексеит, которое строится из двух корней: «бек» (господин, князь, начальник) и «сеит» (вариант арабского «сайид» — господин, потомок пророка Мухаммеда). В тюркской ономастике такие сдвоенные имена с титульными компонентами встречаются часто: они не только фиксировали социальный статус, но и служили пожеланием знатности и уважения. Суффикс -ов типичен для русской адаптации фамилий, поэтому Бексеитов буквально означает «потомок Бексеита».

География бытования фамилии связана в первую очередь с Казахстаном, где имя Бексеит (и его варианты Бексейт, Бексейіт) известно среди казахов, а также с соседними регионами России — Оренбургской, Астраханской областями, где исторически жили казахи и татары. Встречается фамилия и у башкир. В русских документах XIX века такие фамилии закрепились в ходе переписей, когда тюркские имена записывали с русскими падежными окончаниями.

В отличие от фамилий на -ин или -ский, модель образования Бексеитов проста и прозрачна: личное имя плюс патронимический суффикс. Споров о корнях здесь нет — обе части имени хорошо изучены. «Бек» в тюркских языках означал военного или родового вождя, а «сеит» указывало на происхождение из мусульманского духовенства или уважаемого рода. Таким образом, предок носителя фамилии, скорее всего, принадлежал к социальной верхушке — либо к военной знати, либо к потомкам пророка (ходам), либо к тем, кто совмещал оба статуса.

Интересная деталь: в некоторых тюркских диалектах имя Бексеит могло писаться как Бексейт, что отражает местное произношение. В русских метрических книгах встречаются колебания: Бексеитов, Бексейтов, реже Бексеитовъ. Это не разные фамилии, а варианты записи одного и того же имени. При этом фамилия остаётся относительно редкой — её носители не образуют массовых кластеров, что говорит о сохранении родовой линии без массового разветвления.