Фамилия Белковские (в исходной форме — Белковский) образована по типичной для восточнославянских фамилий модели: основа «Белк-» плюс суффикс «-овск-» и окончание «-ий». Суффикс «-овск-» чаще всего указывает на происхождение от географического названия (например, от села Белково, которых в России и Беларуси несколько) или на принадлежность к роду Белко. В основе лежит прозвище Белко, которое напрямую связано с прилагательным «белый». Что именно означало это прозвище для первого носителя, можно предполагать: светлая кожа, белокурые волосы или, что не менее вероятно, внутреннее качество — «белый» в значении «милый, чистый, добрый». В народной речи «белый» нередко означало «хороший, незапятнанный», что отразилось в пословице: «Рубаха черна, да совесть бела».

Словообразовательная цепочка здесь проста: Белко → Белков (сын Белка) → Белковский (потомок Белкова). Фактически фамилия Белковский — это отчество второго порядка, то есть отчество от отчества. Такая форма с окончанием «-ский» характерна для шляхетских и дворянских фамилий Речи Посполитой, а также для фамилий, возникших в среде православного духовенства, которое часто получало фамилии по названиям церквей или сёл. Однако в случае с Белковскими нельзя исключать и чисто бытовое происхождение: в крестьянской среде фамилии на «-ский» могли давать переселенцам из деревни Белково — так обозначали человека, пришедшего «из Белковых».

География фамилии Белковский сегодня охватывает в основном западные регионы России, Беларусь и Украину, что подтверждает её связь с польско-литовским влиянием. Встречается и вариант Белковские — это форма множественного числа, которая в русской традиции часто использовалась для обозначения целого рода («Белковские приехали»). Сравнение с однокоренными фамилиями (Белков, Белко, Беляев) показывает, что Белковский — самая поздняя по времени образования форма, возникшая не ранее XVI–XVII веков, когда модель на «-ский» стала массовой. Точное место и время появления фамилии установить сложно, но сам факт её существования — наглядный пример того, как прозвище, данное по внешности или характеру, превращалось в родовое имя, закрепляясь через поколения.